思うに、普通のドラフトと同じじゃ駄目なのかな？
24人のリストを見て、12球団が1位指名、競合したらくじ引き。
くじにハズレた球団は残った選手からさらにくじ引き、これはドラフトと同じ。

1位指名が多かった球団から2巡目の順番を決める、同数ならくじ引き。
1位競合→1位単独→ハズレ1位競合→ハズレ1位単独→ハズレハズレ1位競合→ハズレハズレ1位単独の順。

それぞれの同数同士のところはくじで順番決定で。全チームが2人交換する形で。
後ろのほうは2巡目の選択肢が強制的に消えるのも仕方なし、人気選手を出さないのが悪いという形で。