2000年 杉山直輝捕手の強制わいせつ致傷事件
スナックに居合わせた女性の体に触れ、靴で頭を殴ったとして逮捕された事件。本件により解雇。

2015年 野球賭博事件
2015年、福田聡志・笠原将生・松本竜也の3投手が野球賭博を行っていたことが発覚し、3選手に対して解雇・無期失格処分が下され、球団に1千万円の制裁金が科せられた。この事件の影響で、原沢敦球団社長が引責辞任。更に、2016年には、高木京介も野球賭博に関与していたことが週刊文春の記事で発覚し、本人も認め同年3月22日に本来なら無期失格処分だが自主申告など情状酌量を配慮して1年間の失格処分（契約解除されたが処分解除後に育成選手として再契約。）。又、球団に5百万円の追徴制裁金が科せられた。

2017年 山口俊投手傷害事件
横浜DeNAベイスターズからFAで移籍した山口俊が、7月17日に酔って警備員に暴行を加え、病院の扉を壊すなどを行った疑いで、検察庁に送検された。8月18日に、球団は山口俊に対して2017年シーズン終了までの出場停止・減俸・罰金の処分が下された。

2018年 SNSわいせつ動画流出事件
河野元貴、篠原慎平両選手がSNSでわいせつ動画を撮影し不特定多数に流出した事件。球団は河野元貴、篠原慎平に対して2018年シーズン終了までの出場停止・減俸・罰金の処分が下された。これが原因で河野・篠原両選手は戦力外通告を受けた。

2018年 選手による窃盗・転売行為
柿澤貴裕選手が読売ジャイアンツ球場のロッカーから、チームメイトの野球用具を盗み売却し、百万円の収入を得ていたことが発覚。同日に解雇・無期失格処分が下され、翌日に神奈川県警捜査三課により窃盗罪で逮捕された。

2025年 オンライン賭博事件
オコエ瑠偉、増田大輝両選手がオンラインカジノを利用した事による問題。