>>142
arrayを使うのはどう？
簡単のために、重ねの最大が2つまでとして、
> matA <- array(NA, c(5, 10, 2))
> matA[3, 5, 1] <- 0.3; matA[2, 7, 1] <- -0.3; matA[1, 4, 1] <- 0;
> matA[3, 5, 2] <- 0.4; matA[1, 4, 2] <- 0.3
> matA[2, 7, ]
[1] -0.3 NA
> matA[3, 5, ]
[1] 0.3 0.4
> matA[1, 2, ]
[1] NA NA

NAがいやなら、na.exclude()でも使えばいい。
matA[3, 5, i]がNAでないなら、matA[3, 5, i + 1]に代入するような条件分岐で一般化すればいい。
別アプローチとしては、要素がlistの行列を作るという手もある。