>>146
リストがお好みなら
> dat <- data.frame(rowA=c(3, 2, 1, 3, 1), colA=c(5, 7, 4, 5, 4), coubA=c(0.3, -0.3, 0, 0.4, 0.3)) #1
> dat2 <- dat[dat$coubA!=0] #2
> matA <- lapply(1:5, function(i) lapply(1:10, function(j) NULL))
> for(i in 1:nrow(dat2)) {
+ v <- dat2[i,]
+ matA[[v$rowA]][[v$colA]] <- c(matA[[v$rowA]][[v$colA]], v$coubA)
+ }
> matA[[2]][[7]]
[1] -0.3
> matA[[3]][[5]]
[1] 0.3 0.4
> matA[[1]][[2]]
NULL

#1 データはデータフレームが分かり易いかと思ってそうしたけど、ベクタでもマトリクスでも
#2 先にcoubA==0を除いたけど後から条件分岐でも良い。
#3 どうも俺が書くと美しくない...(　´･ω･`)