私の見解を述べれば、恐らくは以下の三つが重要かと。即ち：
１．生物進化として、どういう数学的モデルが作れるか。ダーウィニズムの説明。
２．同じゲノムの集合に制御された、全く異なる周期解を調べる。発生と分化。
３．ゲノム解析の結果を『暗号として読む』という事。

この最初のヤツは（進化ゲーム理論の問題だろうから）いいとして、この二つ目が：
★★★『例えば山中因子で初期化したアトに、各個別の組織に発生分化する、その仕組み。』★★★
であり、そしてこの三番目こそが、恐らくは今一番ホットで、しかも「生データが大量
に存在してる」という、遺伝情報の暗号解読の問題ですね。

コレは実際に今問題になってる「ビッグデータをスパコンで何時間もかけて処理する」
という、所謂分子生物学のドライな研究（試験管でやるのをウエットな研究と言う）だ
そうです。一台数億円するというNGS（次世代シーケンサー）からのデータを統計処理
してゲノム情報を読む際に、既存のソフトが何種類もあってそれを使うという形式に整
備されてるそうですが、でもこういう部分には『何がしかの数学の問題が潜んでる』と
は思いますがね。

但しこれがKolmogorovの公理系の一般化と直接に関係してるかどうかは知りませんが。
だから先ずは「数理統計の問題」なんだろうけど。まあ暗号解読だから、古くはTuring
がやった『Bayesianな何か』なんでしょうが。

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追加：こういう話になると私はド素人なので、今後は黙って見るだけにしときますが。