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(3)と(4)の解の比は同じなんでしょう。
(4)でx,yが整数であるとき,対応する(3)の解の比はどうなるんですか?
zを問題にしなければ,(4)で(x,y)が整数となる解は存在しうるので,(3)にはそんな解は存在しませんとは言えません。
(4)でx:yが整数比のとき,(3)ではその解の比はどうなるんですか?

(3)でも、x:yは、整数比となります。

>(3)はyを有理数とすると、xは無理数となる。
のであなたの主張では,(3)には整数比の解は存在しえないのではありませんか?

(3)にはx:yが整数比となる解は存在しません。