起床後→ラン3km

帰宅　食事　(例:オートミール+卵料理+フルーツ+ヨーグルト)

1〜2時間後にジム　→筋トレ45分→ラン3km

帰宅　食事またはプロテイン

このルーティンなら良いんじゃないかな？
空腹時の有酸素で脂肪が燃え、食事でエネルギー回復と血中アミノ酸濃度上げてからの筋トレでパフォーマンスアップ
筋トレでエネルギー消費してからの有酸素で脂肪燃焼アップ
その後に筋肉の回復のためのプロテイン

朝に全部集約するのは仕事とかの都合だとは思うのであれこれ言わない
この場合、夜は抜くのだろうか